Замислите соларни контролер пуњења као регулатор. Он испоручује енергију из фотонапонског панела до системских оптерећења и батерија. Када је батерија скоро пуна, контролер ће смањити струју пуњења како би одржао потребан напон за потпуно пуњење батерије и одржавање њеног нивоа. Могућношћу регулисања напона, соларни контролер штити батерију. Кључна реч је „штити“. Батерије могу бити најскупљи део система, а соларни контролер пуњења их штити и од прекомерног и од недовољног пуњења.

Другу улогу може бити теже разумети, али рад батерија у „делимичном стању напуњености“ може значајно скратити њихов век трајања. Дужи периоди са делимичним стањем напуњености ће узроковати да се плоче оловно-киселинске батерије сулфатирају и значајно смањују очекивани век трајања, а хемијски састав литијумских батерија је подједнако подложан хроничном недовољном пуњењу. У ствари, пражњење батерија до нуле може их брзо убити. Стога је контрола оптерећења за повезана једносмерна електрична оптерећења веома важна. Прекидач за искључивање при ниском напону (LVD) који је укључен у контролер пуњења штити батерије од прекомерног пражњења.

Прекомерно пуњење свих врста батерија може проузроковати непоправљиву штету. Прекомерно пуњење оловно-киселинских батерија може проузроковати прекомерно ослобађање гасова које заправо може „прокључати“ воду, оштећујући плоче батерије тако што их открива. У најгорем случају, прегревање и висок притисак могу изазвати експлозивне резултате након отпуштања.

Типично, мањи контролери пуњења укључују коло за контролу оптерећења. На већим контролерима, одвојени прекидачи и релеји за контролу оптерећења могу се користити и за контролу оптерећења једносмерних оптерећења до 45 или 60 ампера. Поред контролера пуњења, често се користи и драјвер релеја за укључивање и искључивање релеја ради контроле оптерећења. Драјвер релеја укључује четири одвојена канала за давање приоритета критичнијим оптерећењима како би остала укључена дуже од мање критичних оптерећења. Такође је користан за аутоматску контролу покретања генератора и обавештења о алармима.

Напреднији контролери соларног пуњења такође могу да прате температуру и подесе пуњење батерије како би га оптимизовали у складу са тим. Ово се назива температурна компензација, која пуни батерију на виши напон на хладним температурама и нижи напон када је топло.